Contra: Shattered Soldier

2642 ई. में, पृथ्वी पिछले विदेशी संघर्षों से डरी हुई है क्योंकि पर्यावरणीय समस्याएँ मानवता के नियंत्रण से परे हो गई हैं। विकास के दौरान हाइपर-मैग्नेटिक हथियार ग्रिड की खराबी के कारण ग्रह की 80% आबादी पूरी तरह से तबाह हो गई थी। एलियन वॉर्स के नायक बिल राइजर को इस घटना के लिए जिम्मेदार ठहराया गया था, साथ ही अपने साथी लांस बीन की हत्या के लिए भी जिम्मेदार ठहराया गया था, जिसने कथित तौर पर उसे रोकने की कोशिश की थी। उन्हें क्रायोजेनिक जेल में 10,000 साल की सज़ा दी गई। हालाँकि, पाँच साल बाद, 2647 में, पृथ्वी को एक और खतरे का सामना करना पड़ता है क्योंकि एक रहस्यमय और अलौकिक कमांडर के नेतृत्व में आतंकवादी संगठन "ब्लड फाल्कन" दुनिया भर में दहशत फैलाता है। सत्तारूढ़ सरकार, जिसे "ट्रायमविरेट" कहा जाता है, ने ब्लड फाल्कन को बेअसर करने की उम्मीद में, पृथ्वी की रक्षा में उनकी पिछली सफलताओं को देखते हुए, बिल रेज़र को उसकी सजा पूरी करने से पहले रिहा करने का फैसला किया। डॉ. जियो मैंड्रेक के शोध से सरकार द्वारा निर्मित एक उन्नत साइबर सैनिक लूसिया को बिल के प्रयासों में साथ देने और सहायता करने के लिए भेजा जाता है। अंततः बिल को पता चला कि लांस अभी भी जीवित है और वास्तव में वह स्वयं ब्लड फाल्कन का कमांडर है। लांस को हराने के बाद, यह पता चला कि पिछले खेलों के एलियंस ने हमला किया था क्योंकि ट्राइमुविरेट ने गुप्त रूप से उनसे एक रहस्यमय, शक्तिशाली "अवशेष" चुरा लिया था। इस जानकारी के साथ, बिल और लूसिया को ट्रायमविरेट का सामना करना होगा और विदेशी अवशेष के रहस्य को उजागर करना होगा।