Prototype 2

Cốt truyện

Hai năm sau các sự kiện của trò chơi gốc, Trung sĩ James Heller, sau khi trở về từ chuyến lưu diễn ở Iraq, phát hiện ra vợ và con gái mình được tuyên bố là đã chết, khiến anh phải tái gia nhập quân đội trong cuộc chiến cho NYZ chống lại virus Blacklight. Heller được thông báo ngắn gọn về các đợt bùng phát trước đó ở Idaho vào những năm 60 và ở NYZ trong các sự kiện của trò chơi đầu tiên. Sau đó anh ta tìm thấy Mercer và bắt đầu đuổi theo anh ta. Theo đuổi Mercer để trả thù, Heller bị Mercer lây nhiễm một chủng virus khiến anh ta có khả năng siêu phàm tương tự. Sau khi mất điện, Heller tỉnh dậy trong phòng thí nghiệm Vùng Vàng, nơi nhà khoa học Gentek, Tiến sĩ Anton Koenig và Đại tá Blackwatch Douglas Rooks đang thử nghiệm trên anh ta. Heller trốn thoát khỏi căn cứ Gentek, khi Mercer đối mặt với anh ta và tuyên bố Gentek và Blackwatch chịu trách nhiệm tái tạo và nuôi dưỡng virus Blacklight, khiến họ phải chịu trách nhiệm về đợt lây nhiễm thứ hai và cái chết của gia đình Heller. Tiết lộ kế hoạch hạ gục Gentek và Blackwatch, Mercer đề nghị đình chiến với Heller. Không chắc chắn về ý định của Mercer, Heller đến gặp mục sư địa phương của mình, Cha Luis Guerra, để xin lời khuyên và giúp đỡ. Sử dụng thông tin do Guerra cung cấp, Heller đột nhập vào Blacknet Terminal để tìm hiểu và phá hoại một số hoạt động của họ. Dần dần tìm đường đến Blackwatch, Heller cuối cùng đã tìm thấy và đối mặt với Koenig, người tuyên bố đứng về phía anh và tiết lộ chương trình siêu chiến binh của Blackwatch, có tên mã là "Orion". Heller ngăn chặn sự tiến bộ của Dự án: Orion bằng cách giết một siêu chiến binh đã được tiêm DNA của anh ta. Sau khi tiêu diệt một trong những nhà khoa học đứng đầu, Heller phát hiện ra rằng Koenig đang quan sát anh ta để tìm ra điểm yếu của anh ta. Tức giận trước sự phản bội của Koenig, Heller theo dõi anh ta chỉ để phát hiện ra rằng anh ta có sức mạnh tương tự như anh ta và Mercer, và là một trong một số đặc vụ "Tiến hóa" được Mercer cài vào Gentek và Blackwatch. Sau khi đánh bại và tiêu diệt bác sĩ, Mercer tiết lộ với Heller rằng anh ta có ý định tuyển dụng anh ta để cố gắng kiểm soát NYZ. Sự nghi ngờ của anh ngày càng tăng, Guerra sau đó cho Heller xem một đoạn băng ghi lại cảnh Mercer phát tán virus lần thứ hai ở Penn Station, cũng chính là nơi Mercer ban đầu phát tán và nhiễm virus. Tức giận trước sự lừa dối của Mercer, Heller lên đường đến Vùng Xanh để truy lùng tay sai của Mercer, bao gồm cả một đặc vụ Tiến hóa ở Gentek tên là Sabrina Galloway; Tuy nhiên, khi đối đầu với Galloway, Heller miễn cưỡng hợp tác với cô khi cô tiết lộ rằng mình có thể giúp anh ta hạ gục Mercer. Với sự giúp đỡ của Galloway, Heller sớm phát hiện ra rằng Mercer có kế hoạch lây nhiễm toàn thế giới thông qua "Whitelight", một loại vắc xin bị ô nhiễm do Gentek phát hành, thực sự có tác dụng đẩy nhanh quá trình lây nhiễm và tiến hóa hơn là ngăn chặn nó. Thất vọng với việc Heller phá hoại kế hoạch của mình, Mercer giết Cha Guerra; Tuy nhiên, khi tìm thấy xác của anh ta, Heller đau buồn đã sử dụng điện thoại của Guerra để liên lạc với Athena, người liên lạc của Guerra, người được tiết lộ là Dana Mercer. Dana giải thích rằng con gái của Heller, Maya, vẫn còn sống, khiến Heller phải tiến đến Red Zone để hạ gục Mercer và cứu Maya. Sau khi ngăn chặn nỗ lực thứ hai của Blackwatch nhằm san bằng Đảo Manhattan, Rooks giúp Heller tiếp cận con gái mình, nhưng Galloway phản bội anh ta và đưa Maya đến gặp Mercer. Khi đối mặt với Mercer, anh ta tiết lộ rằng anh ta có kế hoạch giải quyết các xung đột quốc tế và các vấn đề thế giới bằng cách lây nhiễm sang toàn bộ loài người, tạo ra một Siêu sinh vật với Maya ở trung tâm một cách hiệu quả. Sau khi Mercer hấp thụ Galloway và những Evolved còn lại, cả hai tham gia vào một cuộc đấu tay đôi đẫm máu, chỉ để James giành chiến thắng và giết và tiêu diệt Mercer. Sau đó, Heller tiêu diệt những kẻ bị nhiễm bệnh ở NYZ cùng với hầu hết Virus Blacklight; sau đó sử dụng những ký ức đã hấp thụ của Mercer, Heller xác định vị trí và giải thoát Maya và Dana khỏi một căn hầm. Câu chuyện sau đó kết thúc với việc cả ba nhìn ra New York trước khi Dana đặt câu hỏi phải làm gì tiếp theo.